复旦 × 斯坦福联手揭秘：AlphaFold真懂“物理”吗？
8.0
来源：
BioTender
发布时间：
2025-07-06 00:51
摘要：
复旦大学与斯坦福大学合作，从全新的能量学角度系统评估了 AlphaFold2 和 AlphaFold3，发现其在侧链非共价相互作用、构象多态性等方面存在显著偏差，提醒研究者在依赖结构预测结果时需谨慎，并建议引入物理能量函数及多构象数据。
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2.0分：文中提出了全新视角评价AlphaFold的物理能量规则，其创新性在于超越传统RMSD评估，但没有直接涉及临床试验或新药/器械审批等更高商业价值领域。
关键证据
近三成侧链氢键和范德华力预测错误
85% 的真实“构象多样性”无法被 AlphaFold3 采样出来
检查了 3900 多个结构中 >340 万个原子相互作用
真实性检查
否