Two stage large language model approach enhancing entity classification and relationship mapping in radiology reports
该研究提出了一种创新的两阶段自然语言处理管道，结合了BERT和大型语言模型（LLM），用于提高放射学报告中临床实体的分类和关系映射能力。通过分析来自首尔阿山医疗中心的超过400,000份报告，研究展示了该管道在胸部CT和脑部MRI报告分析中的有效性，分别达到了77.39和70.58的宏F1分数。这一方法不仅提高了诊断准确性，还为临床决策提供了支持，具有广泛的应用前景。
Beta cell dysfunction occurs independently of insulitis in type 1 diabetes pathogenesis
研究揭示了1型糖尿病（T1D）患者的β细胞在疾病发作时功能受损，且这种损伤与局部自身免疫无关。通过活体胰腺切片模型，研究发现尽管T1D患者的β细胞仍然存活，但在高葡萄糖刺激下的反应显著减弱。这一发现强调了β细胞功能损伤在T1D发病机制中的独立性，为未来的治疗策略提供了重要的研究基础。
Junctional adhesion molecule C limits glioblastoma stem-like cell invasion by regulating integrin adhesion at the endothelial interface
研究发现，Junctional adhesion molecule C (JAMC)在胶质母细胞瘤干细胞（GSC）与内皮细胞的相互作用中扮演重要角色。JAMC的缺失会导致GSC的侵袭性增强，表现出更高的迁移和侵袭能力。这一发现为胶质母细胞瘤的治疗提供了新的潜在靶点，可能通过调节GSC的微环境和细胞间相互作用来改善患者预后。
Role of Hsp70 Chaperone in Client-Protein Folding Elucidated by Markov State Modeling and NMR Restraint-Assisted Molecular Dynamics Simulations
本研究揭示了热休克蛋白70（Hsp70）在客户蛋白折叠中的关键作用，采用马尔可夫状态模型和NMR约束辅助分子动力学模拟，探讨了Hsp70的开闭状态对SH3客户蛋白折叠的影响。研究结果表明，Hsp70的闭合状态通过特定的非极性残基与SH3相互作用，防止了SH3在释放后的非天然疏水性聚集。这一发现为未来的实验提供了重要的靶点，深入理解Hsp70辅助蛋白折叠的分子机制。
A Privacy-Preserving HLA Imputation Method with Homomorphic Encryption
privateHLA是首个使用同态加密的HLA推断方法，旨在解决云计算中数据隐私问题。该方法在保护客户数据和模型隐私方面表现出色，尽管在准确性上略低于CookHLA，但仍优于传统的SNP2HLA方法。此技术的创新性和市场潜力使其在生物技术领域具有重要的投资价值。
pH-dependent DNA degradation pathways for adeno-associated virus gene therapy
研究探讨了腺相关病毒（AAV）载体基因治疗中DNA降解机制，发现酸性和碱性pH条件下的DNA降解对病毒效力有显著影响。研究表明，DNA完整性是AAV基因治疗开发中的关键属性，需在产品开发中加以控制。
Gene conversion-associated successive engineering of modular polyketide synthases
本研究提出了一种基于基因转换的模块化聚酮合酶工程策略，成功实现了对聚酮合酶的连续工程改造，生成了新型聚酮化合物。这一策略不仅展示了聚酮合成的创新潜力，还为药物开发提供了新的思路，可能对抗药性问题的解决产生积极影响。
Next-generation enteric neuroscience — fostering the future of the field
文章探讨了肠神经科学的未来发展，强调了年轻研究者在该领域的重要性。通过回顾Little Brain Big Brain会议的历史，展示了该领域的研究进展和未来方向，突出了年轻研究者的贡献和参与。
The emerging role of the gut microbiome in depression: implications for precision medicine
研究探讨了肠道微生物组在抑郁症中的新兴作用，强调其作为精准医学的潜在诊断和治疗靶点。通过总结与抑郁症相关的微生物组变化及其机制，评估了微生物组在临床应用中的潜力，指出未来在精准医学中的重要性。
Reply to ‘Enhancing spatial transcriptomics in clear-cell renal cell carcinoma’
该文章回应了关于空间转录组学在透明细胞肾细胞癌中的应用的反馈，强调了转录模式在生物标志物开发中的潜在价值。研究者指出，尽管转录和蛋白水平可能存在差异，但转录模式在某些情况下足以界定临床相关表型。
Enhancing spatial transcriptomics in clear-cell renal cell carcinoma
研究探讨了空间转录组学在透明细胞肾细胞癌中的应用，强调了方法论的改进和验证的重要性。通过对转录组数据的验证，提升了对肿瘤微环境的理解，具有重要的临床和研究价值。
A Resource for Exploring Regional Diversity in the Male Rat Brain Synaptic Proteome
该研究通过高分辨率蛋白组分析，生成了六个关键大鼠脑区域的突触蛋白组图谱，识别了3440种蛋白质，揭示了区域特异性的突触蛋白特征。这一成果为理解脑功能和神经疾病机制提供了重要基础，具有潜在的临床应用价值。
Integrating data augmentation and BERT-based deep learning for predicting alpha-glucosidase inhibitors derived from Black Cohosh
研究通过结合数据增强和基于BERT的深度学习模型，成功预测了来自黑升麻的α-葡萄糖苷酶抑制剂actaeaepoxide 3-O-xyloside，显示出其在糖尿病治疗中的潜力。该方法提高了药物发现的效率，强调了利用天然产物作为治疗选择的重要性。
Orthogonal CRISPR systems for targeted integration and multiplex base editing enable nonviral engineering of allogeneic CAR T cells
研究开发了一种新型的CRISPR系统，结合了不同的Cas9酶，实现了无双链断裂的多重基因编辑。这种方法在初级人类T细胞中显示出高效的基因编辑率，且未对CAR T细胞功能产生负面影响，降低了基因组重排的风险。这一创新技术为CAR T细胞疗法的安全性和有效性提供了新的解决方案，具有广泛的临床应用前景。
Large-scale transcriptomic analyses reveal downstream target genes of ZFY1 and ZFY2 transcription factors in male germ cells
本研究通过大规模转录组分析揭示了ZFY1和ZFY2转录因子在雄性生殖细胞中的下游靶基因。这些基因的调控与精子发生、DNA包装及凋亡途径密切相关，表明ZFY在雄性生殖中的关键作用。研究结果为理解ZFY在生殖过程中的功能提供了新的视角，并可能为生物技术领域的应用奠定基础。