Radiomics Quality Score 2.0: what changed from version 1.0 and why it matters
Radiomics Quality Score 2.0 (RQS 2.0)的更新旨在提升放射组学在个性化医学中的临床转化能力。新版本强调公平性、可解释性和质量控制，促进方法透明性和临床目的的明确性。通过标准化技术报告和评估新领域，RQS 2.0为放射组学的科学发展提供了重要框架，反映了国际对该领域的需求和标准化趋势。
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文章回应了关于Radiomics Quality Score 2.0的讨论，强调了其在个性化医疗中的重要性。通过分析87个免疫肿瘤研究，指出大多数研究在能力测试阶段，缺乏必要的验证和报告，建议结合RRL框架进行更一致的基准测试。
Monod: model-based discovery and integration through fitting stochastic transcriptional dynamics to single-cell sequencing data
研究提出了Monod模型，通过拟合随机转录动态来分析单细胞RNA测序数据，旨在揭示细胞功能的转录机制。该方法利用数据的随机性和多模态特性，能够有效区分生物和技术方面的因素，提供对基因调控过程的深入理解。研究涉及多个国际数据集，具有较高的科学性和创新性，适用于脑科学领域。
BioAgents: Bridging the gap in bioinformatics analysis with multi-agent systems
BioAgents is a multi-agent system that enhances bioinformatics workflows by assisting users in developing and troubleshooting complex tasks. It leverages smaller language models to provide personalized and efficient solutions, achieving performance comparable to human experts in conceptual genomics tasks. The system's potential extends beyond bioinformatics, offering applications in clinical settings and other scientific domains, thereby addressing challenges related to reproducibility and accessibility in computational research.
Cinchona-based liquid formulation exhibits antifungal activity through Tryptophan starvation and disruption of mitochondrial respiration in Rhizoctonia Solani
Cinchona基液体配方（CBF）对Rhizoctonia solani展示了显著的抗真菌活性，主要通过诱导色氨酸匮乏和破坏线粒体呼吸来实现。研究表明，CBF在0.1 N HCl中提取的生物活性成分，尤其是奎宁，表现出较高的抗真菌效能，EC50值为217.14 µg/mL。该配方不仅为农业提供了一种生态友好的生物农药选择，还可能在未来的植物病害管理中发挥重要作用。
Hypertension and risk of cancer recurrence in adult survivors: A systematic review and meta-analysis
该系统评价和荟萃分析研究了高血压对成人癌症幸存者肿瘤复发风险的影响。结果显示，高血压与结直肠癌复发风险显著相关，而在乳腺癌和前列腺癌中未发现显著关联。这项研究强调了在癌症幸存者中进行血压控制的重要性，为未来的临床管理提供了依据。
Multifunctionally diverse alkaline phosphatases of Alteromonas drive the phosphorus cycle in the ocean
研究揭示了Alteromonas在海洋磷循环中的关键作用，特别是其碱性磷酸酶（APase）的多功能性。通过全球多组学分析和生化实验，研究表明Alteromonas是主要的APase表达者，尤其在深海环境中。不同APase家族展现出多样的底物偏好和调控机制，强调了酶的多功能性在生物地球化学循环中的重要性。这一发现为理解海洋生态系统中的磷动态提供了新的视角，并可能推动相关生物技术的应用。
Reference genome and population genomic analyses reveal insight into herbicide tolerance in Avena fatua L.
本研究对Avena fatua的基因组进行了全面分析，揭示了其对除草剂的耐受机制及遗传适应性。通过对来自中国不同地区的A. fatua样本进行群体基因组学分析，研究发现了显著的遗传变异和适应性，这些发现可能为农业生物技术和育种项目提供重要信息。研究结果表明，A. fatua的基因组资源可用于开发抗逆境的燕麦品种，具有重要的农业应用潜力。
Integrative human intervention study for mycotoxin biomarker discovery and toxicokinetic characterization
该研究提出了一种综合框架，用于发现真菌毒素生物标志物及其毒代动力学特征，强调了真菌毒素对人类健康的影响。通过人类干预试验，研究识别了新的生物标志物，并利用机器学习和贝叶斯建模进行毒代动力学分析。这一框架为公共卫生提供了重要的风险评估工具，具有潜在的商业价值和创新性。
Cysteine S-acetylation is a widespread post-translational modification on metabolic proteins
研究揭示了半胱氨酸S-乙酰化作为一种重要的后转录修饰，广泛存在于小鼠的代谢蛋白中。通过优化的质谱分析方法，研究者识别了超过400个半胱氨酸乙酰化位点，显示出其在不同组织中的特异性和动态调节能力。这一发现不仅扩展了蛋白质修饰的研究领域，还可能为代谢调节提供新的生物标志物和治疗靶点。
Hydrogen sulfide drives horizontal transfer of plasmid-borne antibiotic resistance genes in wastewater ecosystems
研究发现氢硫化物在废水生态系统中促进了质粒介导的抗生素抗性基因的水平转移，揭示了其在抗性传播中的重要作用。研究表明，氢硫化物通过增强质粒的结合频率和扩展受体范围，重新定义了微生物代谢物在抗性传播中的角色。这一发现为应对抗生素抗性传播提供了新的见解，具有重要的生物技术和环境影响。
The composition and structure of the outer kinetochore KMN complex is conserved across kingdoms
该研究探讨了外部动粒KMN复合体在不同生物中的组成和结构保守性，特别是在阿拉伯芥中的功能。通过亲和纯化和质谱分析，确认了多个关键蛋白的相互作用，揭示了其在细胞分裂中的重要性。这一发现为植物基因组研究和细胞分裂机制提供了新的视角，具有潜在的生物技术应用价值。
GADD45β inhibits hepatic lipogenesis through the AMPK/SREBP1 pathway via reducing the ubiquitination-mediated degradation of SIRT1
本研究揭示了GADD45β在代谢功能障碍相关脂肪肝病（MASLD）中的重要作用，表明其通过稳定SIRT1并抑制其泛素化降解，进而调控AMPK/SREBP1信号通路，抑制肝脏脂质合成。GADD45β的表达在MASLD患者中显著降低，提示其作为潜在治疗靶点的价值。研究结果为MASLD的治疗提供了新的思路，具有较高的商业投资潜力。
AQP7 deficiency drives adipose tissue remodeling and disrupts homeostasis
本研究探讨了水通道蛋白AQP7在脂肪组织重塑和代谢功能中的关键作用，发现其缺失导致小鼠体重增加和内脏脂肪积累。通过人类数据和小鼠模型的结合，研究表明AQP7在维持代谢健康方面的重要性，并可能成为治疗肥胖相关并发症的新靶点。
Functional significance of opioid receptor homomers and heteromers
研究探讨了阿片受体同源体和异源体的功能重要性，强调了其在药物开发中的潜在应用。通过新的结构动态分析，研究揭示了阿片受体的异源体在镇痛和其他生理效应中的作用，具有重要的生物技术价值。